菩提老祖与如来佛祖作为核心组建阵容时，领队角色的选择直接影响队伍的整体表现。菩提老祖作为辅助型角色，擅长为全队提供增益效果和控制能力，而如来佛祖则具备强大的AOE输出能力。当两者同时存在于阵容中时，领队角色的选择需要综合考虑战斗场景、队伍配置及角色特性。
菩提老祖作为领队的优势在于其全面的辅助能力。他能够通过增益技能提升队伍的输出和生存能力，尤其适合需要持久作战的场合。配备生存类装备如轮回罗盘或凤凰之羽能有效提升其生存能力，而能量恢复装备如清风之羽则能保证技能释放频率。选择菩提领队时，队伍应搭配高爆发输出角色如孙悟空，以及强力的前排肉盾如牛魔王，形成攻守兼备的阵容体系。
如来佛祖作为领队则更注重爆发输出。其技能攻击前有10%几率造成群体法术伤害配合仙族护法可形成强力AOE，在短时间内解决战斗。这种配置适合追求速战速决的玩家，但需要搭配保护型角色如大象或燃灯来弥补生存能力的不足。如来领队的阵容通常需要较高成本，适合后期玩家使用，在推图和PVP中都有不错表现。
领队角色的定位决定了装备搭配方向。菩提领队应优先考虑辅助类装备如智慧之书或守护之心，强化治疗效果和增益效果；如来领队则更适合攻击型装备，提升法术伤害和暴击率。无论选择哪位作为领队，都需要确保后排有足够的保护措施，避免核心角色过早阵亡。
阵容搭配的灵活性也是选择领队时需要考虑的因素。菩提领队的阵容可以兼容更多控制型角色如太上老君，形成多面手队伍；如来领队的阵容则更适合纯输出路线，与大鹏、明王等爆发型角色形成组合。两种领队风格各有侧重，玩家应根据已有卡牌资源和战斗偏好做出选择。
最终决策还需结合具体战斗场景进行调整。在高难度副本中，菩提领队的续航能力可能更为重要；而在竞技场等需要快速决胜负的场合，如来领队的爆发优势则更为明显。无论选择哪种领队方式，都需要通过实战检验阵容效果，并不断优化角色间的配合与装备搭配。