从三之岛到口袋妖怪火红的线路攻略需要结合游戏内的船运系统与剧情推进。完成红莲岛道馆挑战后，在道馆外会遇到正辉，触发前往一之岛的剧情。乘坐希加罗普号抵达一之岛宝可梦网络中心，与正辉和阿锦对话可获得陨石、三岛通行证等关键道具。需若未完成三岛主线任务，后续岛屿访问将受限制，需优先解决当前岛屿的剧情任务。
从一之岛出发，需前往灯火山顶部捕获火焰鸟，这是三岛剧情的重要环节。灯火温泉的老爷爷会赠送秘传技能机岩石粉碎（HM06），用于清除灯火山的障碍。随后乘船前往二之岛欢乐游戏厅，触发寻找小迷的支线任务。该任务需在三之岛树果森林驱赶素利拍，完成后返回二之岛交付陨石，获得月之石奖励。此阶段需合理规划路线，避免重复往返消耗时间。
三之岛的核心任务集中在树果森林与港口区域。进入树果森林前需击败暴走族，解救小迷后获得酸木瓜道具。森林内可采集16种树果，同时需注意野生宝可梦的等级较高，建议提前准备恢复道具。返回一之岛宝可梦网络中心与正辉汇合后，可乘船回到红莲岛继续主线。此部分流程涉及多次岛屿切换，建议优先完成道具收集与关键战斗。
最终返回关都地区时，需通过常磐市道馆挑战获取地震技能机（TM26）。该道馆以地面系宝可梦为主，推荐使用水系或草系宝可梦应对。三之岛至火红主线的衔接全部完成，玩家可继续推进二周目内容或探索七之岛等后续区域。整个流程需注意船票的获取与剧情触发顺序，避免遗漏关键道具或任务节点。