疯狂动物园中共有6个主要隐藏任务，分别对应特洛伊斑马、暗黑野牛、哭吼狮与油炸狮、鸭嘴河马、三嘴鸟和恐龙犀牛这几种特殊动物。这些隐藏动物需要通过特定条件触发，完成后可获得对应稀有动物。触发机制涉及连续换乘、长距离骑乘、特定时间操作等技术要点，每个任务都有明确的地理区域限制。
特洛伊斑马需要在草原地图连续换乘7种不同动物，这是最早可解锁的隐藏任务之一。暗黑野牛则要求玩家在草原地图使用野牛不换乘行走800米，考验骑乘稳定性。哭吼狮与油炸狮的触发条件分为两种途径，要么用狮子连续捕食30个动物，要么连续换乘5只狮子，两种方式均可完成任务。
鸭嘴河马任务发生在丛林地图，需要玩家用河马连续撞击15个野兽或保持单只河马骑乘1000米。三嘴鸟的90米跳跃是技术要求最高的任务，必须把握巨嘴鸟暴走上升至最高点的瞬间起跳。恐龙犀牛同样位于丛林地图，需要连续换乘7种不同动物，与特洛伊斑马任务形式类似但区域不同。
隐藏任务的设计逻辑与游戏核心玩法深度结合，通过骑乘时间、换乘次数、动作连击等维度设置挑战。任务触发后目标动物会出现特殊外观或行为特征，如三嘴鸟的三喙造型、暗黑野牛的黑色皮肤等。完成隐藏任务不仅能扩充图鉴，还能解锁对应动物的特殊能力。
游戏内设有明确的进度提示系统，玩家可通过任务日志查看各隐藏任务的完成状态。部分任务如雄鸡鳄存在时间限定机制，仅在上午时段出现。建议优先完成草原区域的隐藏任务，掌握基础操作后再挑战丛林和高难度任务。