挑战联盟冠军时需要准备一套合理的阵容搭配。冠军之路是游戏后期的重要关卡，对手阵容以高等级和多样化属性为主，因此队伍构建需兼顾属性克制与技能覆盖。常见的通关阵容通常包含喷火龙、尼多王、镰刀盔等高种族值宝可梦，搭配特定技能实现推队效果。
喷火龙作为火系主力，可通过修改器调整为干旱特性增强火系技能威力，搭配飞行系招式应对格斗与草系敌人。尼多王凭借毒刺特性防止近身攻击，地震技能能有效打击电系与岩石系对手。火爆猴使用聚焦镜配合集气提升命中要害概率，手刀或十字切作为主要输出手段。这类组合能应对冠军阵容中常见的岩石、冰系等属性。
镰刀盔通过剑舞强化攻击后，鱼跃龙门或劈开技能可造成巨额伤害。袋兽采用替身加猛毒消耗战术，配合百万吨拳击与剩饭回复实现持续作战。部分玩家会选择卡比兽替代袋兽，利用其更高耐久进行防守反击。队伍中还需配置能使用冲浪、攀瀑等秘传技能的宝可梦，便于探索冠军之路的地形障碍。
冠军阵容中的四天王分别专精不同属性。首位罗伊德使用岩石系阵容，水系与草系技能效果显著；菲比的幽灵系队伍需暗影球等克制招式应对；泰丽莎的冰系阵容弱点火系与格斗系；加里奥的龙系宝可梦可用冰系技能压制。最终冠军的混合属性队伍需要根据战场情况灵活切换出战成员。
通关后进入二周目时，可在七岛地区捕获火焰鸟、急冻鸟等传说宝可梦补充阵容。超梦作为隐藏宝可梦出现在华蓝洞窟深处，等级高达70级，需准备充足的治疗道具和高级球。队伍中建议保留会碎岩、怪力等技能的宝可梦，便于解开冠军之路的机关障碍。