紫薇阁作为大掌门2中的重要挑战副本，分为多个难度层级，玩家需通过逐级解锁才能进入更高阶的挑战。该副本的核心机制围绕五行属性相克设计，要求玩家根据关卡特性调整阵容策略。木阁、火阁、土阁的奖励与战斗伤害值直接挂钩，而金阁、水阁则依据战斗回合数判定奖励等级。每次成功通关当前难度后，系统会赠送一次额外挑战机会，若连续两次达到最佳表现，可解锁跳过战斗功能。紫薇阁的挑战不仅考验玩家对弟子培养的深度，更需灵活运用属性克制原理。
木阁作为周常开放关卡，主要产出银两资源，其战斗机制强调爆发输出能力。玩家需在有限时间内最大化伤害输出，因此需优先配置高攻速或高暴击弟子。火阁同样以伤害判定为核心，但敌方单位通常具备更高的防御属性，穿透类武学或内功效果更为关键。土阁的真元奖励对弟子养成至关重要，该关卡敌人往往拥有特殊减伤机制，需通过特定属性组合破解。这三类关卡的共同特点是时间压力较大，合理分配技能释放顺序是突破瓶颈的核心技巧。
金阁与水阁采用回合制评价体系，玩家需在六回合内完成战斗才能获取最高奖励。金阁的突破丹是弟子升阶的重要材料，关卡中敌方阵容常配备控制型技能，因此队伍中需加入解控或免疫类弟子。水阁的弟子经验奖励对快速提升战力至关重要，该关卡敌人以高闪避或反击特性为主，命中属性与群体攻击武学的搭配尤为关键。这两类关卡更注重持久作战能力，续航型心法与回复类技能的配置直接影响通关效率。
紫薇阁的终极挑战在于土阁的真元获取，该关卡融合了伤害输出与生存能力的双重考验。敌方单位通常具备特殊的属性强化机制，会在特定回合触发战力提升。玩家需要精确计算伤害阈值，在关键回合使用爆发技能打断敌方节奏。土阁的难度层级划分最为细致，从简单到困难共设四个阶段，每个阶段都会引入新的战斗机制。高层级挑战中，敌方单位的属性成长曲线显著提升，要求玩家对弟子养成、装备强化、心法搭配等系统有全面理解。
紫薇阁的整体设计体现了大掌门2对策略深度的追求，不同关卡对应不同资源需求，玩家可根据当前养成阶段选择侧重挑战的关卡。副本中所有关卡均有概率掉落元宝奖励，这种随机性设计增加了重复挑战的价值。玩家进度推进，紫薇阁的难度梯度能持续提供适度的挑战性，既不会因难度过高导致挫败感，也不会因过于简单失去重复游玩动力，这种平衡性设计使其成为检验阵容强度的标准试炼场。